تأسس القسم مع تأسيس الكلية عام1999-2000 تحت مسمى قسم التشريح وعلم الأجنة وهو أحد الأقسام الأكاديمية بكلية الطب البشري غريان ويقوم بتدريس علم التشريح وعلم الأجنة لطلبة المرحلة الأساسية كلية الطب البشري السنتين الأولي والثانية.